Protein–RNA interactions for Protein: P70275

Sema3e, Semaphorin-3E, mousemouse

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3eP70275 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema3eP70275 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema3eP70275 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema3eP70275 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema3eP70275 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema3eP70275 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema3eP70275 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema3eP70275 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema3eP70275 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema3eP70275 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema3eP70275 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema3eP70275 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema3eP70275 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema3eP70275 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema3eP70275 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema3eP70275 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema3eP70275 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema3eP70275 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema3eP70275 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema3eP70275 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema3eP70275 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema3eP70275 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema3eP70275 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema3eP70275 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema3eP70275 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema3eP70275 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema3eP70275 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema3eP70275 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema3eP70275 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema3eP70275 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema3eP70275 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema3eP70275 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema3eP70275 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema3eP70275 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema3eP70275 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema3eP70275 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema3eP70275 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema3eP70275 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema3eP70275 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema3eP70275 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema3eP70275 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema3eP70275 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema3eP70275 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema3eP70275 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema3eP70275 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema3eP70275 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema3eP70275 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema3eP70275 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema3eP70275 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema3eP70275 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema3eP70275 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema3eP70275 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema3eP70275 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema3eP70275 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema3eP70275 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema3eP70275 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema3eP70275 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema3eP70275 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema3eP70275 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema3eP70275 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema3eP70275 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema3eP70275 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema3eP70275 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema3eP70275 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema3eP70275 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema3eP70275 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema3eP70275 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema3eP70275 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema3eP70275 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema3eP70275 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema3eP70275 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema3eP70275 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema3eP70275 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema3eP70275 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema3eP70275 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema3eP70275 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema3eP70275 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema3eP70275 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema3eP70275 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema3eP70275 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema3eP70275 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema3eP70275 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema3eP70275 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema3eP70275 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema3eP70275 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema3eP70275 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema3eP70275 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema3eP70275 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema3eP70275 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema3eP70275 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema3eP70275 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema3eP70275 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema3eP70275 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema3eP70275 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema3eP70275 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema3eP70275 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema3eP70275 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema3eP70275 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema3eP70275 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema3eP70275 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.4 ms