Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Traf5P70191 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Traf5P70191 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Traf5P70191 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Traf5P70191 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Traf5P70191 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Traf5P70191 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Traf5P70191 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Traf5P70191 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Traf5P70191 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Traf5P70191 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Traf5P70191 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Traf5P70191 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Traf5P70191 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Traf5P70191 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Traf5P70191 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Traf5P70191 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Traf5P70191 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Traf5P70191 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Traf5P70191 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Traf5P70191 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Traf5P70191 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Traf5P70191 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Traf5P70191 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Traf5P70191 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Traf5P70191 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Traf5P70191 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Traf5P70191 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Traf5P70191 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Traf5P70191 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Traf5P70191 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Traf5P70191 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Traf5P70191 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Traf5P70191 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Traf5P70191 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Traf5P70191 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Traf5P70191 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Traf5P70191 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Traf5P70191 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Traf5P70191 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Traf5P70191 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Traf5P70191 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Traf5P70191 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Traf5P70191 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Traf5P70191 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Traf5P70191 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Traf5P70191 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Traf5P70191 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Traf5P70191 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Traf5P70191 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Traf5P70191 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Traf5P70191 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Traf5P70191 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Traf5P70191 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Traf5P70191 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Traf5P70191 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Traf5P70191 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Traf5P70191 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Traf5P70191 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Traf5P70191 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Traf5P70191 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Traf5P70191 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Traf5P70191 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Traf5P70191 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Traf5P70191 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Traf5P70191 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Traf5P70191 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Traf5P70191 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Traf5P70191 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Traf5P70191 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Traf5P70191 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Traf5P70191 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Traf5P70191 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Traf5P70191 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Traf5P70191 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Traf5P70191 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Traf5P70191 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Traf5P70191 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Traf5P70191 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Traf5P70191 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Traf5P70191 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Traf5P70191 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Traf5P70191 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Traf5P70191 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Traf5P70191 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Traf5P70191 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Traf5P70191 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Traf5P70191 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Traf5P70191 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Traf5P70191 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Traf5P70191 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Traf5P70191 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Traf5P70191 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Traf5P70191 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Traf5P70191 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Traf5P70191 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Traf5P70191 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Traf5P70191 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Traf5P70191 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Traf5P70191 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms