Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtnP63089 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtnP63089 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtnP63089 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtnP63089 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PtnP63089 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtnP63089 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtnP63089 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtnP63089 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtnP63089 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtnP63089 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtnP63089 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtnP63089 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtnP63089 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtnP63089 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtnP63089 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtnP63089 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtnP63089 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtnP63089 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PtnP63089 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtnP63089 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtnP63089 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtnP63089 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PtnP63089 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtnP63089 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtnP63089 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtnP63089 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtnP63089 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtnP63089 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtnP63089 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PtnP63089 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtnP63089 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtnP63089 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtnP63089 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtnP63089 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtnP63089 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtnP63089 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PtnP63089 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtnP63089 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtnP63089 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtnP63089 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtnP63089 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtnP63089 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PtnP63089 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtnP63089 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtnP63089 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtnP63089 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PtnP63089 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PtnP63089 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PtnP63089 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PtnP63089 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PtnP63089 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtnP63089 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtnP63089 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtnP63089 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtnP63089 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtnP63089 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtnP63089 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtnP63089 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtnP63089 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtnP63089 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtnP63089 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtnP63089 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtnP63089 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtnP63089 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtnP63089 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtnP63089 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtnP63089 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtnP63089 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtnP63089 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtnP63089 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtnP63089 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtnP63089 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtnP63089 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtnP63089 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtnP63089 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtnP63089 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtnP63089 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtnP63089 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtnP63089 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PtnP63089 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtnP63089 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtnP63089 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtnP63089 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtnP63089 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtnP63089 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtnP63089 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtnP63089 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtnP63089 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtnP63089 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtnP63089 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtnP63089 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PtnP63089 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtnP63089 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtnP63089 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtnP63089 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtnP63089 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtnP63089 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtnP63089 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtnP63089 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms