Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gabra1P62812 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms