Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copz1P61924 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copz1P61924 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Copz1P61924 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Copz1P61924 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms