Protein–RNA interactions for Protein: P61588

Rnd3, Rho-related GTP-binding protein RhoE, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnd3P61588 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Rnd3P61588 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnd3P61588 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 167.1 ms