Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Depdc5P61460 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Depdc5P61460 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Depdc5P61460 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Depdc5P61460 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Depdc5P61460 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Depdc5P61460 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Depdc5P61460 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Depdc5P61460 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Depdc5P61460 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Depdc5P61460 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Depdc5P61460 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Depdc5P61460 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Depdc5P61460 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Depdc5P61460 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Depdc5P61460 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Depdc5P61460 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Depdc5P61460 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Depdc5P61460 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Depdc5P61460 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Depdc5P61460 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Depdc5P61460 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Depdc5P61460 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Depdc5P61460 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Depdc5P61460 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Depdc5P61460 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Depdc5P61460 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Depdc5P61460 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Depdc5P61460 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Depdc5P61460 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Depdc5P61460 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Depdc5P61460 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Depdc5P61460 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Depdc5P61460 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Depdc5P61460 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Depdc5P61460 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Depdc5P61460 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Depdc5P61460 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Depdc5P61460 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Depdc5P61460 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Depdc5P61460 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Depdc5P61460 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Depdc5P61460 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Depdc5P61460 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Depdc5P61460 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Depdc5P61460 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Depdc5P61460 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Depdc5P61460 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Depdc5P61460 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Depdc5P61460 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Depdc5P61460 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Depdc5P61460 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Depdc5P61460 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Depdc5P61460 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Depdc5P61460 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Depdc5P61460 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Depdc5P61460 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Depdc5P61460 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Depdc5P61460 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Depdc5P61460 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Depdc5P61460 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Depdc5P61460 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Depdc5P61460 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Depdc5P61460 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Depdc5P61460 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Depdc5P61460 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Depdc5P61460 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Depdc5P61460 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Depdc5P61460 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Depdc5P61460 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Depdc5P61460 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Depdc5P61460 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Depdc5P61460 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Depdc5P61460 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Depdc5P61460 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Depdc5P61460 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Depdc5P61460 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Depdc5P61460 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Depdc5P61460 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Depdc5P61460 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Depdc5P61460 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Depdc5P61460 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Depdc5P61460 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Depdc5P61460 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Depdc5P61460 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Depdc5P61460 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Depdc5P61460 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Depdc5P61460 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Depdc5P61460 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Depdc5P61460 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Depdc5P61460 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Depdc5P61460 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Depdc5P61460 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Depdc5P61460 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Depdc5P61460 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Depdc5P61460 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Depdc5P61460 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Depdc5P61460 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Depdc5P61460 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Depdc5P61460 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms