Protein–RNA interactions for Protein: P61022

Chp1, Calcineurin B homologous protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chp1P61022 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chp1P61022 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chp1P61022 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Chp1P61022 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chp1P61022 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chp1P61022 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Chp1P61022 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chp1P61022 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chp1P61022 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chp1P61022 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chp1P61022 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chp1P61022 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chp1P61022 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chp1P61022 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Chp1P61022 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Chp1P61022 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Chp1P61022 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Chp1P61022 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Chp1P61022 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Chp1P61022 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Chp1P61022 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Chp1P61022 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Chp1P61022 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Chp1P61022 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Chp1P61022 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Chp1P61022 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Chp1P61022 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Chp1P61022 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Chp1P61022 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Chp1P61022 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Chp1P61022 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Chp1P61022 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Chp1P61022 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Chp1P61022 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Chp1P61022 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Chp1P61022 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Chp1P61022 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Chp1P61022 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Chp1P61022 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Chp1P61022 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Chp1P61022 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Chp1P61022 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Chp1P61022 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Chp1P61022 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Chp1P61022 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Chp1P61022 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Chp1P61022 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Chp1P61022 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Chp1P61022 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Chp1P61022 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Chp1P61022 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Chp1P61022 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Chp1P61022 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Chp1P61022 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Chp1P61022 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Chp1P61022 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Chp1P61022 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Chp1P61022 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Chp1P61022 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Chp1P61022 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Chp1P61022 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Chp1P61022 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Chp1P61022 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Chp1P61022 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Chp1P61022 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Chp1P61022 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chp1P61022 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chp1P61022 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chp1P61022 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chp1P61022 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chp1P61022 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Chp1P61022 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chp1P61022 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chp1P61022 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chp1P61022 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chp1P61022 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chp1P61022 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chp1P61022 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Chp1P61022 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Chp1P61022 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Chp1P61022 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Chp1P61022 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Chp1P61022 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Chp1P61022 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Chp1P61022 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Chp1P61022 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Chp1P61022 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Chp1P61022 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Chp1P61022 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Chp1P61022 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Chp1P61022 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Chp1P61022 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Chp1P61022 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Chp1P61022 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Chp1P61022 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Chp1P61022 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Chp1P61022 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Chp1P61022 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Chp1P61022 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Chp1P61022 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms