Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppfia3P60469 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppfia3P60469 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppfia3P60469 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppfia3P60469 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppfia3P60469 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppfia3P60469 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppfia3P60469 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppfia3P60469 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppfia3P60469 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppfia3P60469 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppfia3P60469 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppfia3P60469 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppfia3P60469 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppfia3P60469 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppfia3P60469 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppfia3P60469 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppfia3P60469 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppfia3P60469 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppfia3P60469 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppfia3P60469 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppfia3P60469 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppfia3P60469 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppfia3P60469 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppfia3P60469 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppfia3P60469 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppfia3P60469 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppfia3P60469 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppfia3P60469 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppfia3P60469 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppfia3P60469 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppfia3P60469 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppfia3P60469 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppfia3P60469 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppfia3P60469 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppfia3P60469 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppfia3P60469 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppfia3P60469 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppfia3P60469 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppfia3P60469 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppfia3P60469 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppfia3P60469 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppfia3P60469 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppfia3P60469 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppfia3P60469 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppfia3P60469 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppfia3P60469 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppfia3P60469 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ppfia3P60469 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppfia3P60469 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppfia3P60469 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppfia3P60469 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppfia3P60469 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppfia3P60469 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppfia3P60469 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppfia3P60469 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppfia3P60469 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppfia3P60469 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppfia3P60469 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppfia3P60469 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppfia3P60469 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppfia3P60469 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppfia3P60469 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppfia3P60469 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppfia3P60469 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppfia3P60469 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppfia3P60469 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppfia3P60469 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppfia3P60469 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppfia3P60469 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppfia3P60469 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppfia3P60469 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppfia3P60469 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppfia3P60469 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppfia3P60469 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppfia3P60469 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppfia3P60469 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppfia3P60469 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppfia3P60469 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppfia3P60469 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppfia3P60469 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppfia3P60469 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppfia3P60469 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppfia3P60469 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppfia3P60469 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppfia3P60469 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppfia3P60469 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfia3P60469 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfia3P60469 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfia3P60469 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfia3P60469 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfia3P60469 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfia3P60469 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfia3P60469 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfia3P60469 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfia3P60469 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfia3P60469 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfia3P60469 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfia3P60469 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppfia3P60469 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms