Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Paxbp1P58501 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Paxbp1P58501 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Paxbp1P58501 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Paxbp1P58501 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Paxbp1P58501 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Paxbp1P58501 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms