Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Strn4P58404 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Strn4P58404 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Strn4P58404 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Strn4P58404 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Strn4P58404 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Strn4P58404 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Strn4P58404 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Strn4P58404 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Strn4P58404 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Strn4P58404 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Strn4P58404 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Strn4P58404 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Strn4P58404 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Strn4P58404 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Strn4P58404 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Strn4P58404 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Strn4P58404 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Strn4P58404 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Strn4P58404 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Strn4P58404 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Strn4P58404 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Strn4P58404 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Strn4P58404 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Strn4P58404 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Strn4P58404 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Strn4P58404 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Strn4P58404 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Strn4P58404 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Strn4P58404 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Strn4P58404 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Strn4P58404 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Strn4P58404 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Strn4P58404 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Strn4P58404 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Strn4P58404 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Strn4P58404 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Strn4P58404 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Strn4P58404 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Strn4P58404 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Strn4P58404 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Strn4P58404 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Strn4P58404 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Strn4P58404 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Strn4P58404 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Strn4P58404 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Strn4P58404 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Strn4P58404 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Strn4P58404 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Strn4P58404 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Strn4P58404 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Strn4P58404 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Strn4P58404 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Strn4P58404 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Strn4P58404 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Strn4P58404 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Strn4P58404 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Strn4P58404 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Strn4P58404 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Strn4P58404 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Strn4P58404 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Strn4P58404 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Strn4P58404 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Strn4P58404 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Strn4P58404 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Strn4P58404 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Strn4P58404 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Strn4P58404 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Strn4P58404 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Strn4P58404 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Strn4P58404 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Strn4P58404 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Strn4P58404 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Strn4P58404 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Strn4P58404 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Strn4P58404 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Strn4P58404 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Strn4P58404 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Strn4P58404 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Strn4P58404 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Strn4P58404 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Strn4P58404 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Strn4P58404 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Strn4P58404 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Strn4P58404 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Strn4P58404 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Strn4P58404 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Strn4P58404 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Strn4P58404 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Strn4P58404 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Strn4P58404 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Strn4P58404 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Strn4P58404 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Strn4P58404 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Strn4P58404 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Strn4P58404 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms