Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CtnsP57757 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CtnsP57757 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CtnsP57757 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CtnsP57757 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CtnsP57757 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CtnsP57757 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CtnsP57757 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CtnsP57757 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CtnsP57757 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CtnsP57757 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CtnsP57757 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CtnsP57757 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CtnsP57757 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CtnsP57757 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CtnsP57757 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CtnsP57757 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CtnsP57757 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CtnsP57757 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CtnsP57757 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CtnsP57757 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CtnsP57757 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CtnsP57757 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CtnsP57757 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CtnsP57757 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CtnsP57757 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CtnsP57757 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CtnsP57757 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CtnsP57757 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CtnsP57757 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CtnsP57757 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CtnsP57757 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CtnsP57757 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CtnsP57757 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CtnsP57757 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CtnsP57757 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CtnsP57757 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CtnsP57757 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CtnsP57757 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CtnsP57757 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CtnsP57757 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CtnsP57757 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CtnsP57757 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CtnsP57757 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CtnsP57757 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CtnsP57757 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CtnsP57757 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CtnsP57757 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CtnsP57757 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CtnsP57757 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CtnsP57757 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CtnsP57757 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CtnsP57757 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CtnsP57757 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CtnsP57757 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CtnsP57757 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CtnsP57757 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CtnsP57757 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CtnsP57757 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CtnsP57757 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CtnsP57757 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CtnsP57757 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtnsP57757 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtnsP57757 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtnsP57757 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtnsP57757 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtnsP57757 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtnsP57757 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtnsP57757 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtnsP57757 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtnsP57757 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtnsP57757 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtnsP57757 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtnsP57757 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtnsP57757 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtnsP57757 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtnsP57757 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtnsP57757 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtnsP57757 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtnsP57757 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtnsP57757 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtnsP57757 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtnsP57757 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtnsP57757 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CtnsP57757 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtnsP57757 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtnsP57757 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtnsP57757 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtnsP57757 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtnsP57757 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtnsP57757 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtnsP57757 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtnsP57757 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CtnsP57757 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtnsP57757 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtnsP57757 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtnsP57757 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtnsP57757 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtnsP57757 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtnsP57757 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms