Protein–RNA interactions for Protein: P56959

Fus, RNA-binding protein FUS, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FusP56959 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FusP56959 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FusP56959 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FusP56959 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FusP56959 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FusP56959 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FusP56959 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FusP56959 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FusP56959 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FusP56959 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FusP56959 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FusP56959 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FusP56959 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FusP56959 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FusP56959 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FusP56959 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FusP56959 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FusP56959 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FusP56959 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FusP56959 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FusP56959 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FusP56959 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FusP56959 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FusP56959 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FusP56959 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FusP56959 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FusP56959 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FusP56959 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FusP56959 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FusP56959 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FusP56959 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FusP56959 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FusP56959 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FusP56959 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FusP56959 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FusP56959 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FusP56959 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FusP56959 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FusP56959 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FusP56959 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FusP56959 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FusP56959 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FusP56959 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FusP56959 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FusP56959 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FusP56959 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FusP56959 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FusP56959 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FusP56959 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FusP56959 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FusP56959 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FusP56959 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FusP56959 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FusP56959 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FusP56959 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FusP56959 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FusP56959 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FusP56959 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FusP56959 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FusP56959 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FusP56959 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FusP56959 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FusP56959 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FusP56959 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FusP56959 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FusP56959 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FusP56959 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FusP56959 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FusP56959 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FusP56959 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FusP56959 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FusP56959 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FusP56959 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FusP56959 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FusP56959 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FusP56959 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FusP56959 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FusP56959 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FusP56959 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FusP56959 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FusP56959 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FusP56959 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FusP56959 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FusP56959 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FusP56959 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FusP56959 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FusP56959 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FusP56959 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FusP56959 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FusP56959 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FusP56959 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FusP56959 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FusP56959 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FusP56959 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FusP56959 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FusP56959 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FusP56959 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FusP56959 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FusP56959 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FusP56959 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms