Protein–RNA interactions for Protein: P56942

Pmch, Pro-MCH, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmchP56942 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PmchP56942 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PmchP56942 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PmchP56942 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PmchP56942 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PmchP56942 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PmchP56942 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PmchP56942 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PmchP56942 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PmchP56942 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PmchP56942 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PmchP56942 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PmchP56942 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PmchP56942 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PmchP56942 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PmchP56942 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PmchP56942 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PmchP56942 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PmchP56942 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PmchP56942 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PmchP56942 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PmchP56942 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PmchP56942 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PmchP56942 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PmchP56942 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PmchP56942 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PmchP56942 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PmchP56942 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PmchP56942 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PmchP56942 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PmchP56942 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PmchP56942 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PmchP56942 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PmchP56942 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PmchP56942 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PmchP56942 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PmchP56942 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PmchP56942 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PmchP56942 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PmchP56942 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PmchP56942 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PmchP56942 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PmchP56942 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PmchP56942 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PmchP56942 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PmchP56942 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PmchP56942 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PmchP56942 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PmchP56942 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PmchP56942 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PmchP56942 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PmchP56942 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PmchP56942 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PmchP56942 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PmchP56942 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PmchP56942 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PmchP56942 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PmchP56942 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PmchP56942 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PmchP56942 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PmchP56942 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PmchP56942 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PmchP56942 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PmchP56942 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PmchP56942 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PmchP56942 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PmchP56942 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PmchP56942 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PmchP56942 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PmchP56942 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PmchP56942 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PmchP56942 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PmchP56942 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PmchP56942 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PmchP56942 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PmchP56942 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PmchP56942 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PmchP56942 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PmchP56942 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PmchP56942 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PmchP56942 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PmchP56942 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PmchP56942 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PmchP56942 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PmchP56942 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PmchP56942 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PmchP56942 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PmchP56942 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PmchP56942 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PmchP56942 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PmchP56942 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PmchP56942 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PmchP56942 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PmchP56942 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PmchP56942 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PmchP56942 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PmchP56942 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PmchP56942 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PmchP56942 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PmchP56942 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms