Protein–RNA interactions for Protein: P56657

Cyp2c40, Cytochrome P450 2C40, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c40P56657 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp2c40P56657 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp2c40P56657 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp2c40P56657 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp2c40P56657 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp2c40P56657 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp2c40P56657 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp2c40P56657 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp2c40P56657 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp2c40P56657 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp2c40P56657 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp2c40P56657 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp2c40P56657 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp2c40P56657 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp2c40P56657 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp2c40P56657 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp2c40P56657 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp2c40P56657 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp2c40P56657 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp2c40P56657 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp2c40P56657 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp2c40P56657 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp2c40P56657 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp2c40P56657 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp2c40P56657 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp2c40P56657 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp2c40P56657 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp2c40P56657 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp2c40P56657 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp2c40P56657 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp2c40P56657 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp2c40P56657 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyp2c40P56657 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyp2c40P56657 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyp2c40P56657 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyp2c40P56657 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyp2c40P56657 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyp2c40P56657 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyp2c40P56657 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyp2c40P56657 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyp2c40P56657 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyp2c40P56657 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Cyp2c40P56657 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp2c40P56657 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp2c40P56657 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp2c40P56657 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp2c40P56657 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp2c40P56657 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp2c40P56657 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp2c40P56657 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp2c40P56657 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp2c40P56657 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp2c40P56657 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp2c40P56657 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp2c40P56657 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp2c40P56657 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp2c40P56657 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp2c40P56657 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp2c40P56657 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp2c40P56657 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp2c40P56657 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp2c40P56657 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp2c40P56657 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp2c40P56657 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp2c40P56657 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp2c40P56657 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp2c40P56657 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp2c40P56657 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyp2c40P56657 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyp2c40P56657 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyp2c40P56657 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyp2c40P56657 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyp2c40P56657 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyp2c40P56657 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyp2c40P56657 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyp2c40P56657 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyp2c40P56657 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyp2c40P56657 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyp2c40P56657 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyp2c40P56657 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyp2c40P56657 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyp2c40P56657 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyp2c40P56657 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyp2c40P56657 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyp2c40P56657 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyp2c40P56657 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp2c40P56657 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp2c40P56657 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp2c40P56657 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp2c40P56657 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp2c40P56657 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp2c40P56657 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp2c40P56657 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp2c40P56657 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp2c40P56657 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp2c40P56657 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp2c40P56657 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp2c40P56657 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyp2c40P56657 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyp2c40P56657 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms