Protein–RNA interactions for Protein: P56546

Ctbp2, C-terminal-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctbp2P56546 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctbp2P56546 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctbp2P56546 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctbp2P56546 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctbp2P56546 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctbp2P56546 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctbp2P56546 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctbp2P56546 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctbp2P56546 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctbp2P56546 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctbp2P56546 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctbp2P56546 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctbp2P56546 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctbp2P56546 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctbp2P56546 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctbp2P56546 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctbp2P56546 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctbp2P56546 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctbp2P56546 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctbp2P56546 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctbp2P56546 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctbp2P56546 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctbp2P56546 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctbp2P56546 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctbp2P56546 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctbp2P56546 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctbp2P56546 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctbp2P56546 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctbp2P56546 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctbp2P56546 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctbp2P56546 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctbp2P56546 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctbp2P56546 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctbp2P56546 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctbp2P56546 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctbp2P56546 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctbp2P56546 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctbp2P56546 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctbp2P56546 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctbp2P56546 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctbp2P56546 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctbp2P56546 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctbp2P56546 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms