Protein–RNA interactions for Protein: P56475

Gabrr1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrr1P56475 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabrr1P56475 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabrr1P56475 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabrr1P56475 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabrr1P56475 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabrr1P56475 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabrr1P56475 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabrr1P56475 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabrr1P56475 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabrr1P56475 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabrr1P56475 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabrr1P56475 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabrr1P56475 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabrr1P56475 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabrr1P56475 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabrr1P56475 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabrr1P56475 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabrr1P56475 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabrr1P56475 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabrr1P56475 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabrr1P56475 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabrr1P56475 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabrr1P56475 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabrr1P56475 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabrr1P56475 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabrr1P56475 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabrr1P56475 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabrr1P56475 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabrr1P56475 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabrr1P56475 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabrr1P56475 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabrr1P56475 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabrr1P56475 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabrr1P56475 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabrr1P56475 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabrr1P56475 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabrr1P56475 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabrr1P56475 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabrr1P56475 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabrr1P56475 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabrr1P56475 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabrr1P56475 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabrr1P56475 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabrr1P56475 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabrr1P56475 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabrr1P56475 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabrr1P56475 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabrr1P56475 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabrr1P56475 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabrr1P56475 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabrr1P56475 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabrr1P56475 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabrr1P56475 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabrr1P56475 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabrr1P56475 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabrr1P56475 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabrr1P56475 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabrr1P56475 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabrr1P56475 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabrr1P56475 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabrr1P56475 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabrr1P56475 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabrr1P56475 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabrr1P56475 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabrr1P56475 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabrr1P56475 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabrr1P56475 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms