Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CdaP56389 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CdaP56389 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CdaP56389 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CdaP56389 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CdaP56389 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CdaP56389 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CdaP56389 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CdaP56389 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CdaP56389 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CdaP56389 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CdaP56389 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CdaP56389 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CdaP56389 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CdaP56389 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CdaP56389 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CdaP56389 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CdaP56389 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CdaP56389 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CdaP56389 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CdaP56389 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CdaP56389 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CdaP56389 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CdaP56389 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CdaP56389 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CdaP56389 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CdaP56389 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CdaP56389 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CdaP56389 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CdaP56389 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CdaP56389 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CdaP56389 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CdaP56389 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CdaP56389 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CdaP56389 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CdaP56389 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CdaP56389 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CdaP56389 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CdaP56389 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CdaP56389 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CdaP56389 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CdaP56389 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CdaP56389 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CdaP56389 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CdaP56389 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CdaP56389 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CdaP56389 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CdaP56389 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CdaP56389 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CdaP56389 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CdaP56389 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CdaP56389 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CdaP56389 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CdaP56389 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CdaP56389 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CdaP56389 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CdaP56389 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CdaP56389 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CdaP56389 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CdaP56389 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CdaP56389 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CdaP56389 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CdaP56389 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CdaP56389 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CdaP56389 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CdaP56389 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CdaP56389 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CdaP56389 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CdaP56389 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CdaP56389 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CdaP56389 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CdaP56389 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CdaP56389 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CdaP56389 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CdaP56389 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CdaP56389 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CdaP56389 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CdaP56389 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CdaP56389 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CdaP56389 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CdaP56389 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CdaP56389 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CdaP56389 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CdaP56389 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CdaP56389 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CdaP56389 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CdaP56389 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CdaP56389 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CdaP56389 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CdaP56389 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CdaP56389 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CdaP56389 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CdaP56389 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CdaP56389 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CdaP56389 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CdaP56389 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CdaP56389 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CdaP56389 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CdaP56389 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CdaP56389 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms