Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rrp1P56183 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rrp1P56183 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rrp1P56183 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rrp1P56183 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rrp1P56183 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rrp1P56183 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rrp1P56183 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rrp1P56183 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rrp1P56183 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rrp1P56183 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rrp1P56183 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Rrp1P56183 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rrp1P56183 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rrp1P56183 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rrp1P56183 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rrp1P56183 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rrp1P56183 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rrp1P56183 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rrp1P56183 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rrp1P56183 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rrp1P56183 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rrp1P56183 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rrp1P56183 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rrp1P56183 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rrp1P56183 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rrp1P56183 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rrp1P56183 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rrp1P56183 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rrp1P56183 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rrp1P56183 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rrp1P56183 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rrp1P56183 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rrp1P56183 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rrp1P56183 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rrp1P56183 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rrp1P56183 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Rrp1P56183 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rrp1P56183 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms