Protein–RNA interactions for Protein: P55096

Abcd3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd3P55096 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms