Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Faf1P54731 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Faf1P54731 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Faf1P54731 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Faf1P54731 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Faf1P54731 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms