Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rad23aP54726 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms