Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2e3P52483 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2e3P52483 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms