Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ApodP51910 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ApodP51910 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ApodP51910 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ApodP51910 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ApodP51910 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ApodP51910 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ApodP51910 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ApodP51910 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ApodP51910 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ApodP51910 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ApodP51910 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ApodP51910 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ApodP51910 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ApodP51910 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ApodP51910 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ApodP51910 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ApodP51910 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ApodP51910 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ApodP51910 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ApodP51910 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ApodP51910 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ApodP51910 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ApodP51910 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ApodP51910 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ApodP51910 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ApodP51910 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ApodP51910 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ApodP51910 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ApodP51910 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ApodP51910 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ApodP51910 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ApodP51910 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ApodP51910 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ApodP51910 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ApodP51910 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ApodP51910 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ApodP51910 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ApodP51910 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ApodP51910 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ApodP51910 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ApodP51910 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ApodP51910 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ApodP51910 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ApodP51910 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ApodP51910 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ApodP51910 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ApodP51910 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ApodP51910 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ApodP51910 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ApodP51910 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ApodP51910 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ApodP51910 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ApodP51910 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ApodP51910 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ApodP51910 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ApodP51910 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ApodP51910 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ApodP51910 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ApodP51910 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ApodP51910 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ApodP51910 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ApodP51910 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ApodP51910 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ApodP51910 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ApodP51910 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ApodP51910 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ApodP51910 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ApodP51910 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ApodP51910 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ApodP51910 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ApodP51910 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ApodP51910 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ApodP51910 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ApodP51910 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ApodP51910 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ApodP51910 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ApodP51910 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ApodP51910 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ApodP51910 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ApodP51910 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ApodP51910 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ApodP51910 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ApodP51910 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ApodP51910 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ApodP51910 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ApodP51910 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ApodP51910 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ApodP51910 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ApodP51910 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ApodP51910 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ApodP51910 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ApodP51910 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ApodP51910 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ApodP51910 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ApodP51910 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ApodP51910 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ApodP51910 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ApodP51910 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ApodP51910 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms