Protein–RNA interactions for Protein: P51448

Rora, Nuclear receptor ROR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RoraP51448 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RoraP51448 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RoraP51448 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RoraP51448 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RoraP51448 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RoraP51448 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RoraP51448 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RoraP51448 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RoraP51448 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RoraP51448 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RoraP51448 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RoraP51448 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RoraP51448 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RoraP51448 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RoraP51448 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RoraP51448 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
RoraP51448 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RoraP51448 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RoraP51448 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RoraP51448 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RoraP51448 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RoraP51448 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RoraP51448 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RoraP51448 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RoraP51448 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RoraP51448 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RoraP51448 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RoraP51448 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RoraP51448 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RoraP51448 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RoraP51448 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RoraP51448 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RoraP51448 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RoraP51448 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RoraP51448 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RoraP51448 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RoraP51448 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RoraP51448 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RoraP51448 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RoraP51448 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RoraP51448 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RoraP51448 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RoraP51448 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RoraP51448 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RoraP51448 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RoraP51448 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RoraP51448 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RoraP51448 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RoraP51448 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RoraP51448 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RoraP51448 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RoraP51448 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RoraP51448 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RoraP51448 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RoraP51448 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RoraP51448 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RoraP51448 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RoraP51448 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RoraP51448 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RoraP51448 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RoraP51448 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RoraP51448 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RoraP51448 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RoraP51448 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RoraP51448 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RoraP51448 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RoraP51448 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RoraP51448 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RoraP51448 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RoraP51448 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RoraP51448 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RoraP51448 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RoraP51448 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RoraP51448 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RoraP51448 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RoraP51448 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RoraP51448 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RoraP51448 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RoraP51448 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RoraP51448 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RoraP51448 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RoraP51448 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RoraP51448 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RoraP51448 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RoraP51448 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RoraP51448 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RoraP51448 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RoraP51448 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RoraP51448 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RoraP51448 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RoraP51448 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RoraP51448 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RoraP51448 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RoraP51448 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RoraP51448 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RoraP51448 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RoraP51448 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RoraP51448 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RoraP51448 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RoraP51448 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms