Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FmodP50608 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FmodP50608 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FmodP50608 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FmodP50608 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FmodP50608 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FmodP50608 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FmodP50608 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FmodP50608 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FmodP50608 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FmodP50608 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FmodP50608 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FmodP50608 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FmodP50608 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FmodP50608 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FmodP50608 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FmodP50608 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FmodP50608 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FmodP50608 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FmodP50608 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FmodP50608 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FmodP50608 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FmodP50608 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FmodP50608 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FmodP50608 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FmodP50608 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FmodP50608 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FmodP50608 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FmodP50608 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FmodP50608 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FmodP50608 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FmodP50608 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FmodP50608 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FmodP50608 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FmodP50608 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FmodP50608 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FmodP50608 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FmodP50608 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FmodP50608 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FmodP50608 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FmodP50608 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FmodP50608 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FmodP50608 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FmodP50608 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FmodP50608 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FmodP50608 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FmodP50608 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FmodP50608 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FmodP50608 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FmodP50608 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FmodP50608 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FmodP50608 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FmodP50608 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FmodP50608 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FmodP50608 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FmodP50608 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FmodP50608 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FmodP50608 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FmodP50608 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FmodP50608 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FmodP50608 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FmodP50608 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FmodP50608 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FmodP50608 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FmodP50608 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FmodP50608 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FmodP50608 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FmodP50608 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FmodP50608 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FmodP50608 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FmodP50608 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FmodP50608 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FmodP50608 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FmodP50608 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FmodP50608 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FmodP50608 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FmodP50608 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FmodP50608 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FmodP50608 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FmodP50608 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FmodP50608 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FmodP50608 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FmodP50608 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FmodP50608 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FmodP50608 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FmodP50608 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FmodP50608 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FmodP50608 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FmodP50608 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FmodP50608 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FmodP50608 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FmodP50608 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FmodP50608 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FmodP50608 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FmodP50608 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FmodP50608 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FmodP50608 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FmodP50608 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FmodP50608 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FmodP50608 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms