Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnni3P48787 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnni3P48787 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnni3P48787 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnni3P48787 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnni3P48787 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnni3P48787 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnni3P48787 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnni3P48787 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tnni3P48787 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tnni3P48787 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tnni3P48787 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Tnni3P48787 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tnni3P48787 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tnni3P48787 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tnni3P48787 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnni3P48787 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnni3P48787 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnni3P48787 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnni3P48787 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnni3P48787 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnni3P48787 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnni3P48787 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnni3P48787 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnni3P48787 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnni3P48787 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnni3P48787 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnni3P48787 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnni3P48787 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnni3P48787 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnni3P48787 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnni3P48787 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnni3P48787 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnni3P48787 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnni3P48787 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnni3P48787 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnni3P48787 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnni3P48787 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnni3P48787 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnni3P48787 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnni3P48787 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnni3P48787 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnni3P48787 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnni3P48787 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnni3P48787 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnni3P48787 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnni3P48787 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnni3P48787 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnni3P48787 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnni3P48787 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnni3P48787 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnni3P48787 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnni3P48787 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnni3P48787 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnni3P48787 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnni3P48787 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnni3P48787 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnni3P48787 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnni3P48787 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnni3P48787 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnni3P48787 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnni3P48787 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnni3P48787 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnni3P48787 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnni3P48787 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnni3P48787 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnni3P48787 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnni3P48787 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnni3P48787 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnni3P48787 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnni3P48787 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnni3P48787 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnni3P48787 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnni3P48787 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnni3P48787 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnni3P48787 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnni3P48787 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tnni3P48787 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tnni3P48787 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnni3P48787 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnni3P48787 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnni3P48787 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnni3P48787 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnni3P48787 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnni3P48787 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnni3P48787 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnni3P48787 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnni3P48787 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnni3P48787 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnni3P48787 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnni3P48787 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnni3P48787 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnni3P48787 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnni3P48787 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnni3P48787 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnni3P48787 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnni3P48787 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnni3P48787 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnni3P48787 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnni3P48787 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms