Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ptx3P48759 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms