Protein–RNA interactions for Protein: P48754

Brca1, Breast cancer type 1 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca1P48754 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brca1P48754 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brca1P48754 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brca1P48754 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brca1P48754 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brca1P48754 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brca1P48754 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brca1P48754 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Brca1P48754 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brca1P48754 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brca1P48754 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Brca1P48754 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brca1P48754 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brca1P48754 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brca1P48754 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brca1P48754 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brca1P48754 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Brca1P48754 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brca1P48754 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brca1P48754 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Brca1P48754 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brca1P48754 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Brca1P48754 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brca1P48754 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brca1P48754 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brca1P48754 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brca1P48754 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brca1P48754 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brca1P48754 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brca1P48754 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brca1P48754 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brca1P48754 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brca1P48754 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brca1P48754 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brca1P48754 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brca1P48754 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brca1P48754 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brca1P48754 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brca1P48754 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brca1P48754 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brca1P48754 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brca1P48754 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brca1P48754 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brca1P48754 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brca1P48754 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brca1P48754 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Brca1P48754 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brca1P48754 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brca1P48754 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brca1P48754 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Brca1P48754 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brca1P48754 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Brca1P48754 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brca1P48754 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brca1P48754 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brca1P48754 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Brca1P48754 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brca1P48754 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brca1P48754 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brca1P48754 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brca1P48754 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brca1P48754 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brca1P48754 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brca1P48754 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brca1P48754 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brca1P48754 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brca1P48754 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Brca1P48754 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brca1P48754 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brca1P48754 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brca1P48754 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brca1P48754 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brca1P48754 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brca1P48754 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brca1P48754 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brca1P48754 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brca1P48754 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brca1P48754 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brca1P48754 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brca1P48754 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brca1P48754 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brca1P48754 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brca1P48754 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brca1P48754 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Brca1P48754 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brca1P48754 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brca1P48754 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brca1P48754 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Brca1P48754 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Brca1P48754 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brca1P48754 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Brca1P48754 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brca1P48754 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brca1P48754 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Brca1P48754 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brca1P48754 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brca1P48754 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brca1P48754 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Brca1P48754 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Brca1P48754 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms