Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prox1P48437 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prox1P48437 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prox1P48437 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prox1P48437 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prox1P48437 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prox1P48437 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms