Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rfx2P48379 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rfx2P48379 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rfx2P48379 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rfx2P48379 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rfx2P48379 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rfx2P48379 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rfx2P48379 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rfx2P48379 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rfx2P48379 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rfx2P48379 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rfx2P48379 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rfx2P48379 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rfx2P48379 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rfx2P48379 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rfx2P48379 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rfx2P48379 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rfx2P48379 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rfx2P48379 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rfx2P48379 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rfx2P48379 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rfx2P48379 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rfx2P48379 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rfx2P48379 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rfx2P48379 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rfx2P48379 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rfx2P48379 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rfx2P48379 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rfx2P48379 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rfx2P48379 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rfx2P48379 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rfx2P48379 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rfx2P48379 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rfx2P48379 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rfx2P48379 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rfx2P48379 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rfx2P48379 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rfx2P48379 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rfx2P48379 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rfx2P48379 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rfx2P48379 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rfx2P48379 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rfx2P48379 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rfx2P48379 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rfx2P48379 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rfx2P48379 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rfx2P48379 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rfx2P48379 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rfx2P48379 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rfx2P48379 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rfx2P48379 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rfx2P48379 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rfx2P48379 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rfx2P48379 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rfx2P48379 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rfx2P48379 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rfx2P48379 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rfx2P48379 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rfx2P48379 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rfx2P48379 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rfx2P48379 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rfx2P48379 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rfx2P48379 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rfx2P48379 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rfx2P48379 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rfx2P48379 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rfx2P48379 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rfx2P48379 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rfx2P48379 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rfx2P48379 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rfx2P48379 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rfx2P48379 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rfx2P48379 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rfx2P48379 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rfx2P48379 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rfx2P48379 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rfx2P48379 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rfx2P48379 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rfx2P48379 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rfx2P48379 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rfx2P48379 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rfx2P48379 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rfx2P48379 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rfx2P48379 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rfx2P48379 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rfx2P48379 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rfx2P48379 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rfx2P48379 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rfx2P48379 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rfx2P48379 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rfx2P48379 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rfx2P48379 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rfx2P48379 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rfx2P48379 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rfx2P48379 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rfx2P48379 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rfx2P48379 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rfx2P48379 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rfx2P48379 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rfx2P48379 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms