Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl5P47962 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl5P47962 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl5P47962 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl5P47962 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl5P47962 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl5P47962 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl5P47962 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl5P47962 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl5P47962 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl5P47962 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl5P47962 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl5P47962 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl5P47962 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl5P47962 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl5P47962 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl5P47962 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl5P47962 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl5P47962 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl5P47962 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl5P47962 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl5P47962 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl5P47962 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl5P47962 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl5P47962 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl5P47962 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl5P47962 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl5P47962 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl5P47962 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl5P47962 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl5P47962 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl5P47962 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl5P47962 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl5P47962 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl5P47962 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rpl5P47962 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rpl5P47962 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rpl5P47962 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rpl5P47962 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms