Protein–RNA interactions for Protein: P47880

Igfbp6, Insulin-like growth factor-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igfbp6P47880 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Igfbp6P47880 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Igfbp6P47880 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Igfbp6P47880 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Igfbp6P47880 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Igfbp6P47880 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Igfbp6P47880 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Igfbp6P47880 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Igfbp6P47880 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Igfbp6P47880 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Igfbp6P47880 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Igfbp6P47880 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Igfbp6P47880 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Igfbp6P47880 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Igfbp6P47880 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Igfbp6P47880 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Igfbp6P47880 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Igfbp6P47880 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Igfbp6P47880 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Igfbp6P47880 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Igfbp6P47880 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Igfbp6P47880 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Igfbp6P47880 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Igfbp6P47880 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Igfbp6P47880 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Igfbp6P47880 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Igfbp6P47880 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Igfbp6P47880 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Igfbp6P47880 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Igfbp6P47880 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Igfbp6P47880 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Igfbp6P47880 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Igfbp6P47880 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Igfbp6P47880 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Igfbp6P47880 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Igfbp6P47880 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Igfbp6P47880 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Igfbp6P47880 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Igfbp6P47880 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Igfbp6P47880 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Igfbp6P47880 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Igfbp6P47880 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Igfbp6P47880 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Igfbp6P47880 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Igfbp6P47880 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Igfbp6P47880 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Igfbp6P47880 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Igfbp6P47880 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Igfbp6P47880 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Igfbp6P47880 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Igfbp6P47880 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Igfbp6P47880 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Igfbp6P47880 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Igfbp6P47880 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Igfbp6P47880 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Igfbp6P47880 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Igfbp6P47880 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Igfbp6P47880 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Igfbp6P47880 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Igfbp6P47880 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Igfbp6P47880 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Igfbp6P47880 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Igfbp6P47880 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Igfbp6P47880 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Igfbp6P47880 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Igfbp6P47880 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Igfbp6P47880 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Igfbp6P47880 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Igfbp6P47880 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Igfbp6P47880 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Igfbp6P47880 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Igfbp6P47880 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Igfbp6P47880 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Igfbp6P47880 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Igfbp6P47880 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Igfbp6P47880 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Igfbp6P47880 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Igfbp6P47880 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Igfbp6P47880 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Igfbp6P47880 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Igfbp6P47880 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Igfbp6P47880 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Igfbp6P47880 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Igfbp6P47880 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Igfbp6P47880 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Igfbp6P47880 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Igfbp6P47880 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Igfbp6P47880 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Igfbp6P47880 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Igfbp6P47880 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Igfbp6P47880 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Igfbp6P47880 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Igfbp6P47880 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Igfbp6P47880 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Igfbp6P47880 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Igfbp6P47880 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Igfbp6P47880 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Igfbp6P47880 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Igfbp6P47880 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Igfbp6P47880 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms