Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms