Protein–RNA interactions for Protein: P42128

Foxk1, Forkhead box protein K1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 719 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxk1P42128 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxk1P42128 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxk1P42128 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxk1P42128 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxk1P42128 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxk1P42128 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxk1P42128 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxk1P42128 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxk1P42128 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxk1P42128 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxk1P42128 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxk1P42128 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxk1P42128 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxk1P42128 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxk1P42128 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxk1P42128 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxk1P42128 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxk1P42128 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxk1P42128 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxk1P42128 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxk1P42128 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxk1P42128 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxk1P42128 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxk1P42128 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxk1P42128 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxk1P42128 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxk1P42128 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxk1P42128 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxk1P42128 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxk1P42128 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxk1P42128 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxk1P42128 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxk1P42128 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxk1P42128 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxk1P42128 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxk1P42128 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxk1P42128 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxk1P42128 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxk1P42128 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxk1P42128 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxk1P42128 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxk1P42128 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxk1P42128 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxk1P42128 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxk1P42128 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxk1P42128 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxk1P42128 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxk1P42128 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxk1P42128 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxk1P42128 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxk1P42128 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxk1P42128 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxk1P42128 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxk1P42128 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Foxk1P42128 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Foxk1P42128 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Foxk1P42128 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxk1P42128 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxk1P42128 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxk1P42128 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxk1P42128 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxk1P42128 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Foxk1P42128 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxk1P42128 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxk1P42128 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxk1P42128 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxk1P42128 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxk1P42128 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxk1P42128 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxk1P42128 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxk1P42128 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxk1P42128 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxk1P42128 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxk1P42128 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxk1P42128 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxk1P42128 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Foxk1P42128 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxk1P42128 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxk1P42128 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxk1P42128 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxk1P42128 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxk1P42128 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxk1P42128 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxk1P42128 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxk1P42128 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxk1P42128 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxk1P42128 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxk1P42128 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxk1P42128 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxk1P42128 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxk1P42128 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Foxk1P42128 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Foxk1P42128 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Foxk1P42128 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Foxk1P42128 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Foxk1P42128 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Foxk1P42128 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Foxk1P42128 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Foxk1P42128 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Foxk1P42128 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms