Protein–RNA interactions for Protein: P38649

Abo, Histo-blood group ABO system transferase, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AboP38649 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AboP38649 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AboP38649 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AboP38649 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AboP38649 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AboP38649 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AboP38649 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AboP38649 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AboP38649 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AboP38649 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AboP38649 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AboP38649 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AboP38649 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AboP38649 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AboP38649 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AboP38649 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AboP38649 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AboP38649 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AboP38649 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AboP38649 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AboP38649 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AboP38649 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AboP38649 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AboP38649 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
AboP38649 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AboP38649 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AboP38649 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AboP38649 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AboP38649 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AboP38649 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AboP38649 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AboP38649 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AboP38649 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AboP38649 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AboP38649 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AboP38649 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AboP38649 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AboP38649 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AboP38649 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AboP38649 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AboP38649 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AboP38649 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AboP38649 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AboP38649 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AboP38649 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AboP38649 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AboP38649 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AboP38649 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AboP38649 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AboP38649 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AboP38649 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AboP38649 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AboP38649 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AboP38649 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AboP38649 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AboP38649 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AboP38649 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AboP38649 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AboP38649 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AboP38649 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AboP38649 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AboP38649 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AboP38649 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AboP38649 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AboP38649 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AboP38649 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AboP38649 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AboP38649 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AboP38649 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AboP38649 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AboP38649 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
AboP38649 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AboP38649 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AboP38649 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AboP38649 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AboP38649 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AboP38649 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AboP38649 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
AboP38649 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AboP38649 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AboP38649 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AboP38649 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AboP38649 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AboP38649 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
AboP38649 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
AboP38649 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AboP38649 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AboP38649 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AboP38649 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AboP38649 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AboP38649 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AboP38649 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AboP38649 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AboP38649 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AboP38649 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AboP38649 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AboP38649 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AboP38649 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AboP38649 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AboP38649 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms