Protein–RNA interactions for Protein: P36536

Sar1a, GTP-binding protein SAR1a, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1aP36536 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sar1aP36536 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sar1aP36536 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Sar1aP36536 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sar1aP36536 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Sar1aP36536 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sar1aP36536 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sar1aP36536 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sar1aP36536 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sar1aP36536 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sar1aP36536 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sar1aP36536 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sar1aP36536 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sar1aP36536 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sar1aP36536 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sar1aP36536 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sar1aP36536 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sar1aP36536 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sar1aP36536 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sar1aP36536 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sar1aP36536 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms