Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddit3P35639 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddit3P35639 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddit3P35639 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddit3P35639 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddit3P35639 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddit3P35639 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddit3P35639 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddit3P35639 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddit3P35639 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddit3P35639 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddit3P35639 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Ddit3P35639 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddit3P35639 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddit3P35639 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddit3P35639 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddit3P35639 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddit3P35639 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddit3P35639 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddit3P35639 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddit3P35639 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ddit3P35639 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ddit3P35639 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ddit3P35639 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ddit3P35639 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ddit3P35639 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ddit3P35639 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ddit3P35639 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ddit3P35639 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ddit3P35639 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ddit3P35639 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ddit3P35639 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ddit3P35639 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ddit3P35639 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddit3P35639 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddit3P35639 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddit3P35639 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddit3P35639 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddit3P35639 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddit3P35639 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddit3P35639 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddit3P35639 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddit3P35639 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddit3P35639 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddit3P35639 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddit3P35639 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddit3P35639 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddit3P35639 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddit3P35639 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddit3P35639 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddit3P35639 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddit3P35639 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddit3P35639 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddit3P35639 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ddit3P35639 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ddit3P35639 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ddit3P35639 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ddit3P35639 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ddit3P35639 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ddit3P35639 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ddit3P35639 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ddit3P35639 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ddit3P35639 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ddit3P35639 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ddit3P35639 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ddit3P35639 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ddit3P35639 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ddit3P35639 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ddit3P35639 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ddit3P35639 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ddit3P35639 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ddit3P35639 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ddit3P35639 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ddit3P35639 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ddit3P35639 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ddit3P35639 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms