Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptk2P34152 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptk2P34152 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptk2P34152 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptk2P34152 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptk2P34152 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptk2P34152 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptk2P34152 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptk2P34152 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptk2P34152 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptk2P34152 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptk2P34152 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptk2P34152 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptk2P34152 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptk2P34152 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptk2P34152 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptk2P34152 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ptk2P34152 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptk2P34152 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms