Protein–RNA interactions for Protein: P32883

Kras, GTPase KRas, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KrasP32883 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KrasP32883 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KrasP32883 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KrasP32883 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KrasP32883 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KrasP32883 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KrasP32883 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KrasP32883 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KrasP32883 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KrasP32883 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KrasP32883 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KrasP32883 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KrasP32883 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KrasP32883 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KrasP32883 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KrasP32883 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KrasP32883 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KrasP32883 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KrasP32883 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KrasP32883 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KrasP32883 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KrasP32883 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KrasP32883 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KrasP32883 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KrasP32883 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KrasP32883 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KrasP32883 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KrasP32883 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KrasP32883 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KrasP32883 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KrasP32883 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KrasP32883 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KrasP32883 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KrasP32883 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KrasP32883 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KrasP32883 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KrasP32883 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KrasP32883 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KrasP32883 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KrasP32883 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KrasP32883 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KrasP32883 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KrasP32883 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KrasP32883 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KrasP32883 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KrasP32883 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KrasP32883 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KrasP32883 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KrasP32883 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KrasP32883 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KrasP32883 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KrasP32883 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KrasP32883 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KrasP32883 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KrasP32883 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KrasP32883 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KrasP32883 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KrasP32883 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KrasP32883 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KrasP32883 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KrasP32883 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KrasP32883 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KrasP32883 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KrasP32883 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KrasP32883 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KrasP32883 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KrasP32883 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KrasP32883 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KrasP32883 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
KrasP32883 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KrasP32883 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KrasP32883 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KrasP32883 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KrasP32883 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KrasP32883 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KrasP32883 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KrasP32883 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KrasP32883 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KrasP32883 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KrasP32883 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KrasP32883 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KrasP32883 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KrasP32883 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KrasP32883 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KrasP32883 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KrasP32883 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KrasP32883 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KrasP32883 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KrasP32883 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KrasP32883 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KrasP32883 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KrasP32883 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KrasP32883 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KrasP32883 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KrasP32883 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KrasP32883 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KrasP32883 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KrasP32883 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KrasP32883 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KrasP32883 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms