Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxc5P32043 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxc5P32043 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms