Protein–RNA interactions for Protein: P31316

Gsx2, GS homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsx2P31316 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gsx2P31316 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gsx2P31316 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gsx2P31316 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gsx2P31316 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gsx2P31316 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gsx2P31316 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms