Protein–RNA interactions for Protein: P30285

Cdk4, Cyclin-dependent kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk4P30285 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdk4P30285 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdk4P30285 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdk4P30285 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdk4P30285 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdk4P30285 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdk4P30285 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdk4P30285 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdk4P30285 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdk4P30285 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdk4P30285 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdk4P30285 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdk4P30285 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdk4P30285 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdk4P30285 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk4P30285 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk4P30285 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk4P30285 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk4P30285 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk4P30285 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk4P30285 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk4P30285 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk4P30285 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk4P30285 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk4P30285 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk4P30285 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk4P30285 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk4P30285 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk4P30285 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk4P30285 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk4P30285 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk4P30285 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk4P30285 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk4P30285 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk4P30285 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk4P30285 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk4P30285 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk4P30285 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk4P30285 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk4P30285 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk4P30285 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk4P30285 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk4P30285 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk4P30285 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk4P30285 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk4P30285 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk4P30285 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk4P30285 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdk4P30285 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdk4P30285 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdk4P30285 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdk4P30285 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdk4P30285 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdk4P30285 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdk4P30285 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdk4P30285 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdk4P30285 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdk4P30285 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdk4P30285 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdk4P30285 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdk4P30285 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdk4P30285 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdk4P30285 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdk4P30285 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdk4P30285 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Cdk4P30285 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdk4P30285 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdk4P30285 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdk4P30285 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdk4P30285 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdk4P30285 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdk4P30285 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdk4P30285 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdk4P30285 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdk4P30285 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdk4P30285 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdk4P30285 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdk4P30285 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdk4P30285 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdk4P30285 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdk4P30285 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdk4P30285 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdk4P30285 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdk4P30285 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdk4P30285 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdk4P30285 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdk4P30285 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdk4P30285 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdk4P30285 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdk4P30285 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdk4P30285 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdk4P30285 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdk4P30285 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdk4P30285 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdk4P30285 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdk4P30285 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdk4P30285 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdk4P30285 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdk4P30285 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdk4P30285 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms