Protein–RNA interactions for Protein: P29595

Nedd8, NEDD8, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd8P29595 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd8P29595 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd8P29595 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd8P29595 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd8P29595 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd8P29595 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd8P29595 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd8P29595 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd8P29595 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd8P29595 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd8P29595 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nedd8P29595 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd8P29595 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd8P29595 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd8P29595 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd8P29595 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd8P29595 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd8P29595 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd8P29595 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd8P29595 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd8P29595 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd8P29595 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd8P29595 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd8P29595 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd8P29595 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd8P29595 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd8P29595 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd8P29595 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd8P29595 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd8P29595 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd8P29595 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd8P29595 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nedd8P29595 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nedd8P29595 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nedd8P29595 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nedd8P29595 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nedd8P29595 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nedd8P29595 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nedd8P29595 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nedd8P29595 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nedd8P29595 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nedd8P29595 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nedd8P29595 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nedd8P29595 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nedd8P29595 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd8P29595 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd8P29595 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd8P29595 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd8P29595 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd8P29595 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd8P29595 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd8P29595 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd8P29595 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd8P29595 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd8P29595 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd8P29595 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd8P29595 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd8P29595 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd8P29595 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nedd8P29595 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nedd8P29595 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nedd8P29595 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nedd8P29595 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nedd8P29595 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nedd8P29595 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Nedd8P29595 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nedd8P29595 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nedd8P29595 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nedd8P29595 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nedd8P29595 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nedd8P29595 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nedd8P29595 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nedd8P29595 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nedd8P29595 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nedd8P29595 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nedd8P29595 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nedd8P29595 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nedd8P29595 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nedd8P29595 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd8P29595 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd8P29595 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd8P29595 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd8P29595 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd8P29595 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd8P29595 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd8P29595 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd8P29595 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd8P29595 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd8P29595 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nedd8P29595 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd8P29595 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd8P29595 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd8P29595 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd8P29595 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd8P29595 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd8P29595 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd8P29595 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd8P29595 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd8P29595 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nedd8P29595 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms