Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PtprmP28828 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PtprmP28828 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PtprmP28828 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PtprmP28828 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PtprmP28828 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PtprmP28828 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PtprmP28828 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PtprmP28828 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PtprmP28828 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PtprmP28828 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PtprmP28828 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PtprmP28828 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PtprmP28828 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PtprmP28828 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PtprmP28828 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PtprmP28828 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PtprmP28828 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PtprmP28828 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PtprmP28828 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PtprmP28828 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PtprmP28828 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PtprmP28828 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PtprmP28828 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PtprmP28828 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PtprmP28828 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PtprmP28828 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PtprmP28828 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PtprmP28828 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PtprmP28828 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PtprmP28828 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PtprmP28828 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PtprmP28828 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PtprmP28828 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PtprmP28828 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PtprmP28828 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PtprmP28828 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PtprmP28828 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PtprmP28828 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PtprmP28828 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PtprmP28828 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PtprmP28828 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PtprmP28828 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PtprmP28828 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PtprmP28828 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PtprmP28828 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PtprmP28828 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PtprmP28828 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PtprmP28828 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PtprmP28828 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PtprmP28828 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PtprmP28828 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PtprmP28828 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PtprmP28828 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PtprmP28828 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PtprmP28828 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PtprmP28828 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PtprmP28828 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PtprmP28828 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PtprmP28828 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PtprmP28828 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PtprmP28828 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PtprmP28828 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PtprmP28828 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PtprmP28828 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PtprmP28828 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PtprmP28828 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PtprmP28828 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PtprmP28828 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PtprmP28828 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PtprmP28828 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PtprmP28828 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PtprmP28828 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PtprmP28828 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PtprmP28828 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PtprmP28828 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PtprmP28828 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PtprmP28828 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PtprmP28828 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PtprmP28828 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PtprmP28828 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PtprmP28828 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PtprmP28828 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PtprmP28828 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PtprmP28828 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PtprmP28828 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PtprmP28828 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PtprmP28828 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PtprmP28828 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PtprmP28828 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PtprmP28828 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PtprmP28828 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PtprmP28828 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PtprmP28828 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PtprmP28828 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PtprmP28828 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PtprmP28828 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
PtprmP28828 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
PtprmP28828 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.04
PtprmP28828 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms