Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NapbP28663 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NapbP28663 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NapbP28663 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NapbP28663 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NapbP28663 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NapbP28663 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NapbP28663 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NapbP28663 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NapbP28663 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NapbP28663 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NapbP28663 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NapbP28663 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NapbP28663 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NapbP28663 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NapbP28663 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NapbP28663 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NapbP28663 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NapbP28663 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NapbP28663 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NapbP28663 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NapbP28663 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NapbP28663 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NapbP28663 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NapbP28663 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NapbP28663 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NapbP28663 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NapbP28663 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NapbP28663 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NapbP28663 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NapbP28663 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NapbP28663 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NapbP28663 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NapbP28663 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NapbP28663 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NapbP28663 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NapbP28663 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NapbP28663 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NapbP28663 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NapbP28663 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NapbP28663 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NapbP28663 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NapbP28663 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NapbP28663 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NapbP28663 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NapbP28663 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NapbP28663 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NapbP28663 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NapbP28663 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NapbP28663 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NapbP28663 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NapbP28663 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NapbP28663 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NapbP28663 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NapbP28663 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NapbP28663 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NapbP28663 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NapbP28663 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NapbP28663 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NapbP28663 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NapbP28663 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NapbP28663 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NapbP28663 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NapbP28663 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NapbP28663 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NapbP28663 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NapbP28663 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NapbP28663 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NapbP28663 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NapbP28663 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NapbP28663 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NapbP28663 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NapbP28663 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NapbP28663 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NapbP28663 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NapbP28663 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NapbP28663 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NapbP28663 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NapbP28663 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NapbP28663 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NapbP28663 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NapbP28663 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NapbP28663 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NapbP28663 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NapbP28663 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NapbP28663 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NapbP28663 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NapbP28663 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NapbP28663 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NapbP28663 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NapbP28663 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NapbP28663 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NapbP28663 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NapbP28663 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NapbP28663 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NapbP28663 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NapbP28663 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NapbP28663 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NapbP28663 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NapbP28663 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms