Protein–RNA interactions for Protein: P28571

Slc6a9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a9P28571 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc6a9P28571 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms