Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apex1P28352 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Apex1P28352 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apex1P28352 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apex1P28352 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apex1P28352 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apex1P28352 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apex1P28352 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apex1P28352 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apex1P28352 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apex1P28352 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apex1P28352 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Apex1P28352 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apex1P28352 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apex1P28352 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apex1P28352 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apex1P28352 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apex1P28352 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apex1P28352 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apex1P28352 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Apex1P28352 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apex1P28352 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apex1P28352 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apex1P28352 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apex1P28352 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apex1P28352 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apex1P28352 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apex1P28352 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apex1P28352 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apex1P28352 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apex1P28352 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apex1P28352 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apex1P28352 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apex1P28352 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apex1P28352 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apex1P28352 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apex1P28352 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apex1P28352 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apex1P28352 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apex1P28352 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apex1P28352 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apex1P28352 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apex1P28352 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apex1P28352 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Apex1P28352 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apex1P28352 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apex1P28352 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apex1P28352 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apex1P28352 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apex1P28352 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apex1P28352 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apex1P28352 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apex1P28352 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apex1P28352 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apex1P28352 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apex1P28352 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Apex1P28352 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Apex1P28352 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apex1P28352 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Apex1P28352 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apex1P28352 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apex1P28352 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apex1P28352 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apex1P28352 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apex1P28352 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apex1P28352 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apex1P28352 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apex1P28352 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apex1P28352 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apex1P28352 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apex1P28352 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apex1P28352 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apex1P28352 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apex1P28352 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apex1P28352 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apex1P28352 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apex1P28352 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apex1P28352 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apex1P28352 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apex1P28352 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apex1P28352 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apex1P28352 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apex1P28352 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apex1P28352 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apex1P28352 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apex1P28352 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apex1P28352 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apex1P28352 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apex1P28352 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apex1P28352 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apex1P28352 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apex1P28352 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apex1P28352 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apex1P28352 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apex1P28352 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apex1P28352 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apex1P28352 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apex1P28352 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apex1P28352 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apex1P28352 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms