Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LoxP28301 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LoxP28301 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LoxP28301 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LoxP28301 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LoxP28301 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LoxP28301 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LoxP28301 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LoxP28301 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LoxP28301 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LoxP28301 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LoxP28301 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LoxP28301 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LoxP28301 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LoxP28301 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LoxP28301 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LoxP28301 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LoxP28301 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LoxP28301 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LoxP28301 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LoxP28301 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LoxP28301 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LoxP28301 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LoxP28301 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LoxP28301 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LoxP28301 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LoxP28301 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LoxP28301 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LoxP28301 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LoxP28301 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LoxP28301 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LoxP28301 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LoxP28301 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LoxP28301 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LoxP28301 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LoxP28301 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LoxP28301 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LoxP28301 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LoxP28301 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LoxP28301 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LoxP28301 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LoxP28301 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LoxP28301 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LoxP28301 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LoxP28301 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LoxP28301 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LoxP28301 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LoxP28301 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LoxP28301 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LoxP28301 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LoxP28301 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LoxP28301 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LoxP28301 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LoxP28301 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LoxP28301 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LoxP28301 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LoxP28301 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LoxP28301 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LoxP28301 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LoxP28301 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LoxP28301 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LoxP28301 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LoxP28301 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LoxP28301 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LoxP28301 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LoxP28301 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LoxP28301 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LoxP28301 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LoxP28301 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LoxP28301 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LoxP28301 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LoxP28301 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LoxP28301 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LoxP28301 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LoxP28301 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LoxP28301 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LoxP28301 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LoxP28301 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LoxP28301 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LoxP28301 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LoxP28301 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LoxP28301 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LoxP28301 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LoxP28301 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LoxP28301 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LoxP28301 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LoxP28301 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LoxP28301 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LoxP28301 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LoxP28301 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LoxP28301 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LoxP28301 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LoxP28301 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LoxP28301 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LoxP28301 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LoxP28301 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LoxP28301 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LoxP28301 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LoxP28301 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LoxP28301 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms