Protein–RNA interactions for Protein: P28271

Aco1, Cytoplasmic aconitate hydratase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aco1P28271 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aco1P28271 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aco1P28271 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aco1P28271 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aco1P28271 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aco1P28271 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aco1P28271 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aco1P28271 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aco1P28271 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aco1P28271 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aco1P28271 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aco1P28271 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aco1P28271 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Aco1P28271 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aco1P28271 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aco1P28271 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aco1P28271 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aco1P28271 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aco1P28271 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aco1P28271 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aco1P28271 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aco1P28271 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aco1P28271 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Aco1P28271 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Aco1P28271 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Aco1P28271 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Aco1P28271 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Aco1P28271 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Aco1P28271 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Aco1P28271 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Aco1P28271 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Aco1P28271 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Aco1P28271 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Aco1P28271 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Aco1P28271 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Aco1P28271 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Aco1P28271 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Aco1P28271 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Aco1P28271 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Aco1P28271 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Aco1P28271 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Aco1P28271 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Aco1P28271 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Aco1P28271 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Aco1P28271 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Aco1P28271 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Aco1P28271 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Aco1P28271 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Aco1P28271 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Aco1P28271 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Aco1P28271 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Aco1P28271 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Aco1P28271 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Aco1P28271 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Aco1P28271 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Aco1P28271 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Aco1P28271 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Aco1P28271 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Aco1P28271 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Aco1P28271 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Aco1P28271 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Aco1P28271 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Aco1P28271 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Aco1P28271 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Aco1P28271 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Aco1P28271 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Aco1P28271 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Aco1P28271 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Aco1P28271 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Aco1P28271 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Aco1P28271 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Aco1P28271 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Aco1P28271 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Aco1P28271 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Aco1P28271 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Aco1P28271 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Aco1P28271 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Aco1P28271 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Aco1P28271 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Aco1P28271 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Aco1P28271 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Aco1P28271 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Aco1P28271 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Aco1P28271 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Aco1P28271 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Aco1P28271 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Aco1P28271 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Aco1P28271 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Aco1P28271 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Aco1P28271 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Aco1P28271 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Aco1P28271 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Aco1P28271 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Aco1P28271 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Aco1P28271 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Aco1P28271 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Aco1P28271 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Aco1P28271 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Aco1P28271 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Aco1P28271 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms